在回双叶镇的客船上，智看出了刚有心事的样子，问道：“刚你怎么了？”
霞调笑道：“这可不像平常的刚哦！”
刚道：“我只是......想呼吸一下新鲜的空气。”
光道：“就是这样才奇怪啊！刚你有什么事可以跟我们。”
智走到了刚的身边，拍了拍了刚的肩膀道：“抵达港口后，我们几人就要分别了！”
刚道：“智你们就是从双叶镇的港口踏入神奥地区的旅程的吧！”
智道：“是啊！回关东后，我们还能结伴旅行一段路程，刚要回尼比市吧！我送霞回华蓝市后，我也要回真新镇一趟，大木博士应该在等着我关于月月熊的论文，再陪我妈妈几，然后就前往合众地区。”
光道：“我也要回家待几，好好吃几顿妈妈做的饭菜，虽然刚和智都做饭很好吃。”
正在此时，突然传来一阵求救的声音，是个女生在求救：“快来人，求求你们帮帮忙吧！”
智四人赶到的时候，客船的船舱中不知道什么时候闯进了许多只的毒刺水母，几只年幼的宝宝丁、皮丘、果然它们都中毒了。
智运转沧海之力，安抚好了毒刺水母它们重新回到海中后，智他们又将受到毒刺水母攻击的宝可梦都集中在了一起，中毒的宝可梦不少，但那几只年幼的宝可梦中毒更加严重，尤其是皮丘。
它们都是宝可梦托儿所的实习老师信子负责照鼓宝可梦，已经有人联系了最近的宝可梦中心的乔伊姐，但因为这里是在海上的客船，赶到最近的宝可梦中心也需要两个时。
智道：“刚，我相信以你的能力可以帮助它们的！也能同时帮助到你！”
刚笑道：“还是智你最了解我！”刚拿出了听诊器做了检查，智从背包中拿出几种树果递给刚，刚研磨果实后制成了果汁，宝可梦们的情况都好转了起来。
只是皮丘喝了解毒用的果汁后却还在发烧。刚的好园着急之下进化成了吉利蛋，用生蛋技能帮助皮丘恢复了体力，再加上智的常磐之力很快就恢复了健康。
两个时后通信船就到了宝可梦中心所在的岛，乔伊姐帮忙检查了一下中毒的宝可梦的情况，全部都已经恢复了健康。皮丘它们几只已经在皮卡丘的带领下玩耍了起来，一点都看不到刚才还是中毒的状态。
信子看着恢复健康的宝可梦，朝刚道谢道：“刚先生，真是非常谢谢你！”
刚连忙摆手道：“要谢就谢智提供的树果吧！我只是做了急救措施而已。”
乔伊姐道：“刚你应该能成为一个很出色的宝可梦医生呢！”
“宝可梦医生？！”
乔伊姐的话似乎在刚的心中点燃了一盏指路的明灯，刚笑道：“原来，还有这条路啊！”
刚的犹豫与顾虑似乎都消失了，智道：“看样子刚你不再迷茫了，你也找到了自己的路！”
刚道：“没错！大家听我，我要将累积至今的饲育家经验好好运用，成为一名宝可梦医生！但我也不会放弃我的世界第一的饲育家梦想的，就像智同时进行道馆赛和华丽大赛那样！”
“既然决定了，那么我就必须好好学习，没有办法像过去一样旅行各地了！智我跟你的旅程也将告一段落！”
光道：“宝可梦医生啊！听起来好酷啊！刚我们都相信你能成为最优秀的宝可梦医生的！”
霞道：“刚，我们都一起好好努力吧！”
智道：“那我们就各自向着各自的目标而不断前进吧！”
“好！”众人齐声道。
客船在傍晚时分到达了双叶镇的港口，彩子在这里已经等候多时了！
次日，智三人要乘坐的回关东的船将在下午三点出发，早晨众人在电视机前观看了大叶挑战竹兰的冠军挑战赛。
大叶的烈焰猴不敌竹兰的裂咬陆鲨最终依旧败北。
光送智三冉了码头，道：“大家要保重哦！要开船了，大家都快上船吧！”
霞抱住了光，柔声道：“光这个世界没有想象中的大，来关东的话就到华蓝市找我哦！”
智道：“神奥时空传有一句是这么的，友情是珍珠，回忆是钻石。光没问题的！”
光擦掉了眼泪笑道：“嗯，有时间我会去找大家的！”
“智、刚、霞，我真的很感谢你们！”
“波加！”
前往关东的船开走了，智三人也即将回到关东。
火箭队三人这边，因为将银河队覆灭以及逮捕猎人J的事情成自己的功劳上报之后，竟然真的得到了火箭队老大板木的赏识，似乎要委以重任。
智三人再次来到分别的三岔路口，只是这次智要跟霞先去华蓝市，刚要返回尼比剩
刚道：“要在这里分别了！”
智道：“是啊！”智伸出了手，刚也握住了智的手，两饶肩膀相碰，智道：“刚，我相信你一定能成为宝可梦医生的！”
刚道：“未来的宝可梦大师，不过现在基本已经算是了吧！”
“那么......再见了！”
“皮卡！”
神奥地区的旅程结束了，但是新的合众地区的旅程又要开始了！